1-BIN-301 Metódy v bioinformatike
Odporúčaný ročník: | 3. |
Semester: | zimný |
Rozsah: | P2,C2 |
Hodnotenie: | 40/60 |
Počet kreditov: | 6 |
Vyučujúci: | prednáša Mgr. Tomáš Vinař PhD. prednáša doc. Mgr. Bronislava Brejová PhD. |
www stránka: | http://compbio.fmph.uniba.sk/vyuka/mbi/ |
Cieľ:
Úvod do základných problémov a metód bioinformatiky, oboznámenie sa s ich praktickou aplikáciou a limitáciami.
Sylabus:
Základné pojmy z molekulárnej biológie, algoritmov a strojového učenia. Sekvenovanie a zostavovanie genómov. Hľadanie génov. Zarovnávanie sekvencií. Evolučné modely a fylogenetické stromy. Komparatívne metódy. Štruktúra RNA. Hľadanie motívov. Štruktúra a funkcia proteínov. Vybrané aktuálne témy.
Literatúra:
Durbin, Eddy, Krogh, Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press 1998.